Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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