Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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PTPN13Q12923 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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PTPN13Q12923 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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PTPN13Q12923 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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PTPN13Q12923 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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PTPN13Q12923 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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