Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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GRIN2AQ12879 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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