Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms