Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms