Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms