Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 NT5C3AP1-202ENST00000441170 1663 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 KCNN2-202ENST00000503706 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 C1GALT1C1-201ENST00000304661 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 RPL7P13-201ENST00000415103 741 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 LINC01066-201ENST00000415283 399 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC003075.1-206ENST00000448664 541 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AP000793.1-201ENST00000527364 740 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CYP2C19-202ENST00000480405 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 ACAT1-202ENST00000299355 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 ALX1-201ENST00000316824 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MAGT1-202ENST00000373336 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC009110.1-201ENST00000415422 558 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC116366.2-201ENST00000454380 767 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 RN7SL716P-201ENST00000580539 268 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms