Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPL23P62829 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPL23P62829 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPL23P62829 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPL23P62829 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPL23P62829 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPL23P62829 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPL23P62829 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPL23P62829 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPL23P62829 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPL23P62829 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPL23P62829 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPL23P62829 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPL23P62829 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPL23P62829 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RPL23P62829 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RPL23P62829 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RPL23P62829 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RPL23P62829 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RPL23P62829 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RPL23P62829 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RPL23P62829 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RPL23P62829 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms