Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
UFM1P61960 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UFM1P61960 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UFM1P61960 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UFM1P61960 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UFM1P61960 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UFM1P61960 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UFM1P61960 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UFM1P61960 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UFM1P61960 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UFM1P61960 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
UFM1P61960 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UFM1P61960 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UFM1P61960 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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