Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms