Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms