Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms