Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DAP3P51398 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms