Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATMP50440 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATMP50440 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATMP50440 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATMP50440 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATMP50440 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATMP50440 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATMP50440 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATMP50440 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATMP50440 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATMP50440 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATMP50440 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATMP50440 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATMP50440 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATMP50440 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GATMP50440 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GATMP50440 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms