Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GNPDA1P46926 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNPDA1P46926 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms