Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCC3P46736 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms