Protein–RNA interactions for Protein: P32929

CTH, Cystathionine gamma-lyase, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHP32929 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHP32929 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHP32929 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHP32929 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHP32929 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHP32929 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHP32929 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHP32929 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHP32929 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHP32929 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHP32929 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHP32929 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHP32929 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHP32929 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHP32929 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHP32929 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHP32929 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHP32929 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHP32929 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHP32929 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHP32929 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHP32929 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHP32929 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHP32929 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHP32929 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHP32929 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms