Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms