Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
POLR1AO95602 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms