Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC9O60706 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms