Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms