Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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