Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CTDSP2O14595 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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