Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRPO00253 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRPO00253 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRPO00253 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRPO00253 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRPO00253 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRPO00253 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRPO00253 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRPO00253 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRPO00253 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRPO00253 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRPO00253 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRPO00253 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRPO00253 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRPO00253 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRPO00253 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRPO00253 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRPO00253 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRPO00253 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRPO00253 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRPO00253 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRPO00253 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRPO00253 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms