Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms