Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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HDGFL3Q9Y3E1 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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HDGFL3Q9Y3E1 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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HDGFL3Q9Y3E1 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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HDGFL3Q9Y3E1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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HDGFL3Q9Y3E1 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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HDGFL3Q9Y3E1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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HDGFL3Q9Y3E1 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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HDGFL3Q9Y3E1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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HDGFL3Q9Y3E1 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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HDGFL3Q9Y3E1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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HDGFL3Q9Y3E1 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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HDGFL3Q9Y3E1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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HDGFL3Q9Y3E1 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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HDGFL3Q9Y3E1 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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