Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms