Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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