Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEMTQ9UBM1 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEMTQ9UBM1 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEMTQ9UBM1 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEMTQ9UBM1 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEMTQ9UBM1 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEMTQ9UBM1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PEMTQ9UBM1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEMTQ9UBM1 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PEMTQ9UBM1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEMTQ9UBM1 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEMTQ9UBM1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEMTQ9UBM1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEMTQ9UBM1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEMTQ9UBM1 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEMTQ9UBM1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEMTQ9UBM1 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEMTQ9UBM1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEMTQ9UBM1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEMTQ9UBM1 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEMTQ9UBM1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PEMTQ9UBM1 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEMTQ9UBM1 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms