Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms