Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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