Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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USP29Q9HBJ7 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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