Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms