Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CNPPD1Q9BV87 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CNPPD1Q9BV87 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CNPPD1Q9BV87 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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CNPPD1Q9BV87 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CNPPD1Q9BV87 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CNPPD1Q9BV87 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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