Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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