Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms