Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGD4Q96M96 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms