Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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GTF3C6Q969F1 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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GTF3C6Q969F1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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GTF3C6Q969F1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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GTF3C6Q969F1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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GTF3C6Q969F1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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GTF3C6Q969F1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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GTF3C6Q969F1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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