Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCSTNQ92542 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCSTNQ92542 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NCSTNQ92542 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCSTNQ92542 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCSTNQ92542 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCSTNQ92542 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCSTNQ92542 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCSTNQ92542 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCSTNQ92542 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCSTNQ92542 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCSTNQ92542 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCSTNQ92542 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCSTNQ92542 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCSTNQ92542 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCSTNQ92542 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCSTNQ92542 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCSTNQ92542 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCSTNQ92542 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCSTNQ92542 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCSTNQ92542 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
NCSTNQ92542 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCSTNQ92542 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms