Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms