Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCG3Q8WXD2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms