Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms