Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms