Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms