Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 LINC00969-213ENST00000445707 2363 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ZNF221-204ENST00000592350 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PAXIP1-AS2-203ENST00000449486 2121 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SNTG1-202ENST00000518864 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PDE6B-201ENST00000255622 3280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PHACTR3-205ENST00000395636 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 LMCD1-AS1-201ENST00000420095 2144 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SLC16A7-203ENST00000547379 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CDK5RAP1-201ENST00000339269 1891 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SEMA4G-205ENST00000517724 2675 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AL592528.1-201ENST00000380008 3466 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PAX6-257ENST00000639409 2450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 EME1-201ENST00000338165 2339 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ZMAT4-202ENST00000315769 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CTSE-201ENST00000358184 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 RHD-210ENST00000622561 3007 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms