Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms