Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms