Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms