Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms