Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms